Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EEFSECP57772 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms