Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP107P57740 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP107P57740 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP107P57740 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP107P57740 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP107P57740 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP107P57740 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms