Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSCP56915 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSCP56915 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSCP56915 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSCP56915 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSCP56915 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSCP56915 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSCP56915 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSCP56915 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSCP56915 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSCP56915 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSCP56915 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms