Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLTPP55058 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLTPP55058 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLTPP55058 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLTPP55058 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLTPP55058 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLTPP55058 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLTPP55058 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PLTPP55058 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLTPP55058 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLTPP55058 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLTPP55058 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms