Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPAP53621 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPAP53621 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPAP53621 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPAP53621 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPAP53621 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPAP53621 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPAP53621 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms