Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms