Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms