Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP11P51784 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP11P51784 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP11P51784 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP11P51784 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP11P51784 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP11P51784 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP11P51784 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP11P51784 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP11P51784 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP11P51784 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP11P51784 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms