Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCR4P51679 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCR4P51679 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCR4P51679 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms