Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRE11P49959 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRE11P49959 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRE11P49959 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms