Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFBP49765 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms