Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP4P49662 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP4P49662 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP4P49662 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP4P49662 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP4P49662 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP4P49662 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP4P49662 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP4P49662 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP4P49662 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP4P49662 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP4P49662 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP4P49662 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms