Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME1P48163 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME1P48163 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME1P48163 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME1P48163 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ME1P48163 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME1P48163 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms