Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL29P47914 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL29P47914 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL29P47914 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms