Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL5P42830 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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