Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBEC1P41238 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms