Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPHP41219 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPHP41219 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPHP41219 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPHP41219 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPHP41219 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms