Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MLH1P40692 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MLH1P40692 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MLH1P40692 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MLH1P40692 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms