Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGAEP38570 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms