Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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CASQ1P31415 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CASQ1P31415 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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