Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms