Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD10P28358 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD10P28358 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms