Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMB4P28070 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMB4P28070 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms