Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTSSP25774 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms