Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YY1P25490 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
YY1P25490 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YY1P25490 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
YY1P25490 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
YY1P25490 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YY1P25490 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YY1P25490 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
YY1P25490 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YY1P25490 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YY1P25490 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YY1P25490 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YY1P25490 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YY1P25490 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YY1P25490 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YY1P25490 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms