Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms