Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RAB4AP20338 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB4AP20338 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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