Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF3P18847 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF3P18847 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF3P18847 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF3P18847 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF3P18847 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF3P18847 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF3P18847 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms