Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XBP1P17861 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XBP1P17861 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XBP1P17861 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XBP1P17861 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XBP1P17861 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XBP1P17861 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms