Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD8P13378 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms