Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XRCC5P13010 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XRCC5P13010 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms