Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGB3P0DN86 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms