Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P0C879 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0C879 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0C879 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0C879 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms