Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP1P09874 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP1P09874 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP1P09874 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms