Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB1P08034 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB1P08034 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB1P08034 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB1P08034 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB1P08034 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB1P08034 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB1P08034 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms