Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLEC3BP05452 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms