Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYCNP04198 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYCNP04198 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms