Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTNP04004 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTNP04004 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTNP04004 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTNP04004 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTNP04004 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTNP04004 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTNP04004 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTNP04004 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTNP04004 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTNP04004 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTNP04004 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTNP04004 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTNP04004 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms