Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV12-3P01733 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV12-3P01733 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms