Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOSP01100 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOSP01100 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOSP01100 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSP01100 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSP01100 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSP01100 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSP01100 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSP01100 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOSP01100 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOSP01100 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOSP01100 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms