Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZBED1O96006 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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