Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD3O95983 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3O95983 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3O95983 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms