Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms