Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB11O95342 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms