Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAMTA2O94983 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAMTA2O94983 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms