Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN5O75503 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms