Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms