Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD28O15084 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms