Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLGNO14967 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLGNO14967 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLGNO14967 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLGNO14967 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLGNO14967 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLGNO14967 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLGNO14967 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLGNO14967 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLGNO14967 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLGNO14967 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLGNO14967 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLGNO14967 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms