Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFIT3O14879 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms